"Apoiar o desenvolvimento social, educacional e cultural de Sorocaba e Região, objetivando a formação do cidadão e ao bem estar da comunidade, sob à luz de princípios cristãos".
A missão da Fundação Dom Aguirre é compartilhada com suas entidades mantidas, as quais desempenham papéis fundamentais para seu sucesso, conforme detalhados em suas respectivas missões: